Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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