Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms