Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms