Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms