Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms