Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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