Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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