Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms