Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spty2d1Q68FG3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spty2d1Q68FG3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 586.6 ms