Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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