Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Gm42441-201ENSMUST00000199778 748 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VcanQ62059 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VcanQ62059 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VcanQ62059 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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VcanQ62059 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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