Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm28047Q3US59 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm28047Q3US59 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm28047Q3US59 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28047Q3US59 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28047Q3US59 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28047Q3US59 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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