Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Q3U6N9 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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