Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Otud5Q3U2S4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Otud5Q3U2S4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Otud5Q3U2S4 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Otud5Q3U2S4 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Otud5Q3U2S4 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Otud5Q3U2S4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.7 ms