Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms