Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms