Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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