Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms