Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms