Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms