Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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