Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ythdf1P59326 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.7 ms