Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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