Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms