Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CntfP51642 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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CntfP51642 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CntfP51642 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CntfP51642 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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