Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SftpdP50404 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms