Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VdrP48281 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms