Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms