Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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