Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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