Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TP20293 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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