Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms