Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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