Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms