Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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