Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04213 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04213 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04213 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04213 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04213 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04213 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04213 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04213 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04213 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04213 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P04213 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04213 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04213 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04213 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04213 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04213 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04213 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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