Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tgfb1P04202 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tgfb1P04202 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms