Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm4340L7N2C4 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm4340L7N2C4 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm4340L7N2C4 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm4340L7N2C4 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm4340L7N2C4 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm4340L7N2C4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm4340L7N2C4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4340L7N2C4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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