Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
XntrpcF8VQM8 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms