Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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