Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clrn2B2RVW2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms