Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms