Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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