Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms