Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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