Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Chrac1Q9JKP8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms