Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc97Q9DBT3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc97Q9DBT3 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc97Q9DBT3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc97Q9DBT3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms