Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms