Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms