Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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